Разрушения логической структуры приводят к потере доступа к разделам диска, исчезновению элементов файловой системы, отображению разделов как неформатированных и т.п. Как и в предыдущем случае, важно минимизировать количество обращений к диску. Поэтому работа ведется только с точной посекторной копией диска, без внесения изменений в логическую структуру накопителя.
В современных ноутбуках, серверах и другой компьютерной технике (медицинском оборудовании, автомобильных компьютерах и др.) доступ к жесткому диску может быть защищен паролем. При работе с таким НЖМД предварительно производится снятие пароля при помощи специальных программных и аппаратных средств.
Основное правило после (случайного) удаления данных – как можно меньше обращений к жесткому диску со стороны пользователя. Для гарантированного восстановления удаленных файлов, работы следует проводить только с образом диска. В сервисном центре "Отвертка" используются технологии неразрушающего копирования, позволяющие создать точную посекторную копию возобновляемого диска, не внося изменений в исходный накопитель.
Отказ электроники жесткого диска – одна из наиболее частых причин потери информации. В противоположность распространенному мнению, замена контроллера современного винчестера автоматически не решает проблемы. Это объясняется тем, что служебная информация (данные о количестве головок, разметке диска и т.п.), хранится в микросхеме BIOS на плате контроллера. Необходимо восстановить («перепрошить») BIOS винчестера, чтобы привести в соответствие служебную информацию контроллера и гермоблока.